Physikalisches Seminar (Biophysik): Potenzielle Bachelorarbeitsthemen – Übersicht

Biophysikseminar (Physikalisches Seminar Biophysik) 3 ECTS-Punkte

Dieses Seminar bietet Bachelorstudenten die Möglichkeit einen Seminarvortrag über spezielle biophysikalische Methoden und aktuelle biophysikalische Fragestellungen zu halten. Es besteht gegebenenfalls die Möglichkeit, anschließend darüber auch eine Bachelorarbeit durchzuführen.

Die Vorbesprechung und Themenvergabe wird im November sein (vorr. im Seminarraum L181 des LS Gaub Amalienstr. 1. Stock.) Die Seminartage sind am 15. und 22. Januar 2020 von 9:00 bis ca. 14:00.       

Die Vorträge können in deutscher oder englischer Sprache präsentiert werden und sollten 20 min dauern. Im Anschluss gibt es jeweils eine kurze Fragerunde in der alle Studenten zur Mitarbeit aufgerufen sind.

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Anmeldungen:    (per Mail an Martin Benoit)

Ch. Handelshauser
M. A.-Juanatey
Ch. Reinmoser
F. Bruce Boye
Ch. Wegener
M. Hörmann
C. Gebauer
L. Morguet
A. Scherer
A. Gruber
T. Forster
K. Dreßel
S. Sachs
L. Raab
J. Pauw
M. Rau

Seminarthemen    ^{_{(wurden am 13.November vergeben und werden im Januar von den Teilnehmern im Seminar vorgetragen)}}

 AG Veigel:

 "Single molecule mechanics of myosin motors"     (Luis Morguet)

Literatur:
1. Lights action: optical tweezers, Justin Molloy and Miles Padgett; Contemporary Physics 43, 241-258 (2002)
2. Movement and force produced by a single myosin head, Molloy et al; Nature 378, 209-212 (1995)
3. Load-dependent kinetics of force production by smooth muscle myosin measured with optical tweezers, Veigel et al; Nature Cell Biology 5, 980-986 (2003)

 "Processive movement of single motor proteins"   (Sebastian Sachs)

Literatur:
1.Lights action: optical tweezers; Justin Molloy and Miles Padgett; Contemporary Physics 43, 241-258 (2002)
2. Force and velocity measured for single kinesin molecules; Karel Svoboda and Steve Block; Cell 77, 773-784 (1994)
3. Mechanics of the kinesin step; Nicolas Carter and Robert Cross; Nature 435, 308-312 (2005)
4. The gaited gate of the molecular motor, myosin-V; Veigel et al; Nature Cell Biology 4, 59-65 (2002)

AG Braun:

 "A Prebiotic chemistry in thermophoretic traps for polymerization"          
  (Miguel Atienza Juanatey)

Literatur:
1: PNAS 110, 8030-8035 (2013), doi:10.1073/pnas.1303222110
2: Chemical Science 10, 5807 - 5814 (2019), doi:10.1039/C9SC00770A

 "Formamide and RNA in a temperature gradient"   (Kira Dreßel)

Literatur:
1: ChemBioChem 15, 879–883 (2014), doi: 10.1002/cbic.201300773
2: Nature Chemistry (2019), doi.org/10.1038/s41557-019-0299-5

"Cooperative ligation and molecular replication"     (n.n)

Literatur:

"Periodic Melting of Oligonucleotides by Oscillating Salt Concentrations triggered by Microscale Water Cycles inside Heated Rock Pores"             (Maximilian Rau)

Literatur:

 AG Liedl:

 "DNA origami crystal solar cells"                              (Anton Scherer)

Literatur:

 "DNA Photonic crystals"                                            (Lena Raab)

Literatur:

 AG Rädler:

 "Collective Cell Migration"                                        (Florian Bruce Boye)

Literatur:
T. E. Angelini, E. Hannezo, X. Trepat, M. Marquez, J. J. Fredberg, and D. A. Weitz, “Glass-like dynamics of collective cell migration,” P Natl Acad Sci Usa, vol. 108, no. 12, pp. 4714–4719, 2011.
A.-K. Marel, M. Zorn, C. Klingner, R. Wedlich-Soldner, E. Frey, and J. O. Rädler, “Flow and Diffusion in Channel-Guided Cell Migration,” Biophys J, vol. 107, no. 5, pp. 1054–1064, Sep. 2014.
S. R. K. Vedula, A. Ravasio, C. T. Lim, and B. Ladoux, “Collective Cell Migration: A Mechanistic Perspective,” Physiology, vol. 28, no. 6, pp. 370–379, Nov. 2013.

"Single Cell Dynamics in Micro-Pattern"                  (Christian Reinmoser)

Literatur:
D. B. Brückner, A. Fink, C. Schreiber, P. J. F. Röttgermann, J. O. Rädler, and C. P. Broedersz, “Stochastic nonlinear dynamics of confined cell migration in two-state systems,” NATURE PHYSICS, vol. 19, p. 1592, Mar. 2019.

K. Kushiro and A. R. Asthagiri, “Modular Design of Micropattern Geometry Achieves Combinatorial Enhancements in Cell Motility,” Langmuir, vol. 28, no. 9, pp. 4357–4362, Mar. 2012.

 AG Lamb:

 "Degradation mechnism of MOF nanoparticles revealed by Raman spectroscopy"
   (Maximilian Hörmann)

Literatur:

"Raman correlation spectroscopy an MOFs"          (Fabian Pauw)

Literatur:

 AG Lipfert:

 “Magnetic nanoparticles for the manipulation of molecules and cells”     
   (Christian Wegener)

Literatur:

 “Nucleosome interaction probed by magnetic tweezers and AFM imaging”
   (Armin Gruber)

Literatur:

“The Salt Dependence of DNA’s Torque and Twist Response”                     
  (Tobias Forster)

 AG Gaub:

"AFM-Kraftmikroskopie am von Willebrandfaktor"    (Carl Gebauer)

Literatur:
1. Jochen P. Müller et al. PNAS (2016), doi: 10.1073/pnas.1516214113
2. Jochen P. Müller et al. Biophysical Journal (2016) doi:10.1016/j.bpj.2016.06.022

Zu Fragen oder zur Anmeldung zum Seminar bitte eine Email an martin.benoit@physik.uni-muenchen.de